Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZCCHC12Q6PEW1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC12Q6PEW1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms