Protein–RNA interactions for Protein: Q6P656

CFAP161, Cilia- and flagella-associated protein 161, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP161Q6P656 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP161Q6P656 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP161Q6P656 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms