Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A4Q6AI14 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms