Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INTS3Q68E01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INTS3Q68E01 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms