Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf135Q5VTT2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf135Q5VTT2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms