Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF20Q5VTR2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF20Q5VTR2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms