Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms