Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms