Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP2LQ5T4T6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms