Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms