Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms