Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF542PQ5EBM4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms