Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC1Q4ZHG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC1Q4ZHG4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms