Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC36A3Q495N2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC36A3Q495N2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms