Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms