Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDRF1Q3B7T1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms