Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UVSSAQ2YD98 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UVSSAQ2YD98 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UVSSAQ2YD98 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms