Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FHOD3Q2V2M9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FHOD3Q2V2M9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms