Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VWC2Q2TAL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VWC2Q2TAL6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms