Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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