Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMN1Q16637 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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