Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1AQ16623 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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