Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USF2Q15853 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USF2Q15853 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USF2Q15853 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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