Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms