Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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