Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATMQ13315 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATMQ13315 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATMQ13315 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATMQ13315 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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