Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSTF3Q12996 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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