Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFEMP1Q12805 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EFEMP1Q12805 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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