Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GTF3C1Q12789 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF3C1Q12789 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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