Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNA1Q09470 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNA1Q09470 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms