Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms