Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNB3Q05901 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNB3Q05901 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms