Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP1Q04837 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP1Q04837 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms