Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBE1Q04446 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms