Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RELBQ01201 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RELBQ01201 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RELBQ01201 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RELBQ01201 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELBQ01201 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELBQ01201 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELBQ01201 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELBQ01201 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELBQ01201 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELBQ01201 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELBQ01201 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms