Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKOR1P84550 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms