Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ELF3P78545 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ELF3P78545 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ELF3P78545 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ELF3P78545 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ELF3P78545 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ELF3P78545 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELF3P78545 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELF3P78545 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELF3P78545 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELF3P78545 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELF3P78545 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELF3P78545 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms