Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX4P78413 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX4P78413 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX4P78413 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX4P78413 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX4P78413 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX4P78413 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX4P78413 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX4P78413 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms