Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNA1P78396 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms