Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPL23P62829 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL23P62829 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL23P62829 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL23P62829 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL23P62829 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms