Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK11-1P61568 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms