Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms