Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SESN3P58005 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SESN3P58005 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SESN3P58005 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SESN3P58005 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SESN3P58005 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SESN3P58005 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SESN3P58005 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SESN3P58005 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SESN3P58005 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SESN3P58005 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SESN3P58005 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SESN3P58005 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SESN3P58005 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SESN3P58005 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SESN3P58005 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SESN3P58005 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SESN3P58005 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SESN3P58005 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms