Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms