Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL4CP56559 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms