Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRP55822 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRP55822 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRP55822 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRP55822 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SH3BGRP55822 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SH3BGRP55822 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms