Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX9P55771 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX9P55771 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PAX9P55771 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PAX9P55771 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX9P55771 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAX9P55771 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAX9P55771 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms