Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC13P55735 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC13P55735 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC13P55735 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC13P55735 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC13P55735 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC13P55735 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC13P55735 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC13P55735 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC13P55735 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC13P55735 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC13P55735 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC13P55735 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC13P55735 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC13P55735 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC13P55735 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms