Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFDNP55196 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AFDNP55196 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFDNP55196 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFDNP55196 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFDNP55196 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFDNP55196 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFDNP55196 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFDNP55196 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFDNP55196 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
AFDNP55196 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AFDNP55196 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AFDNP55196 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AFDNP55196 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AFDNP55196 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AFDNP55196 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AFDNP55196 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AFDNP55196 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AFDNP55196 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AFDNP55196 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFDNP55196 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AFDNP55196 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
AFDNP55196 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
AFDNP55196 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
AFDNP55196 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFDNP55196 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFDNP55196 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFDNP55196 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFDNP55196 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFDNP55196 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AFDNP55196 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AFDNP55196 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFDNP55196 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFDNP55196 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms