Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms